Появление Института биохимии в структуре Сибирского отделения Академии медицинских наук было не случайно. Оно подготовлено всем ходом развития событий, связанных с формированием медицинской академической науки на Востоке страны. Уже в 1971г. в составе Института клинической и экспериментальной медицины Сибирского филиала АМН СССР (ИКЭМ СО АМН СССР) появилась лаборатория биохимии, на базе которой выполнялись фундаментальные исследования по адаптации человека к условиям Сибири и Азиатского Севера. Постановлением ЦК КПСС и СМ СССР от 13 августа 1979г. №778 «О дальнейшем развитии медицинской науки в районах Сибири и Дальнего Востока» в СО АМН СССР было предусмотрено открытие Института биохимии. Однако первый в Сибири Институт биохимии появился только 10 лет спустя, когда лаборатория биохимии трансформировалась в отдел биохимии ИКЭМ СО АМН СССР. В этот период в отделе уже была необходимая материально-техническая база и работал большой профессиональный коллектив ученых.
На заседании Президиума АМН СССР 6 апреля 1988г. рассмотрен вопрос «О развитии основных направлений области биохимии в Сибирском отделении АМН СССР в свете постановления ЦК КПСС и Совета Министров СССР №778». Принято постановление организовать в Новосибирске Институт биохимии, поручив ему разработку следующих направлений научной деятельности:
- изучение биохимических механизмов стресса и перестройки гомеостатических систем человека и животных при действии на организм экологических факторов Сибири и Севера;
- изучение молекулярных механизмов межклеточных взаимодействий в норме и в условиях функционального напряжения гомеостатических систем с целью разработки методов управления пролиферативными, дистрофическими и регенераторными процессами;
- разработка методов коррекции нарушений обмена веществ, биохимических основ рационального питания и метаболизма ксенобиотиков с применением различных методов, в том числе и методов химического микроанализа.
21 сентября 1988г. на заседании Коллегии МЗ СССР было принято решение об организации Института биохимии СО РАМН в г. Новосибирске, протокол №28-3. На этом основании 26 октября 1988г. был издан приказ МЗ СССР №782 «Об организации в г.Новосибирске Института биохимии Сибирского отделения АМН СССР» с возложением на него функции «ведущего (головного) учреждения в области молекулярных механизмов адаптации и гомеостаза, поручив ему координацию работ по проблемам биохимии, молекулярной биологии, биотехнологии и химического микроанализа». Этим же приказом Институту биохимии были переданы штатная численность научных сотрудников 50 ед. с фондом заработной платы, используемое научное оборудование и занимаемые площади (около 1000кв.м.). Обязанности директора института были возложены на член-корр. АМН СССР (ныне академика РАМН) Л.Е.Панина.